П'ятий з одинадцяти діти Рафаеле, інженер і математик, та Сільвія Валле, нащадок неаполітанської та іспанської знаті, мали важке дитинство через проблеми зі здоров'ям та фінансові труднощі сім'ї.
У 1896 році, з розлученням батьків, отець Доліндо (чий ім'я означає "біль") пройшов ініціацію разом з братом Еліо в Апостольській школі священиків-місіонерів, а через три роки був прийнятий до новіціяту.
Він склав релігійні обітниці 1 червня 1901 року, а через два роки безуспішно просив відправити його місіонером до Китаю.
Після висвячення 24 червня 1905 року, у віці майже 23 років, був призначений професором семінаристів Апостольської школи та викладачем григоріанського співу. На короткий час переїхав до Таранто, а потім до семінарії в Мольфетті, де викладав і працював над реформою самої семінарії.
29 жовтня 1907 року його викликали назад до Неаполя і наказали припинити займатися цією справою. Звинувачений в тому, що він є "формальним і догматичним єретиком", він відправився в Рим, щоб підкоритися суду Священної канцелярії: після чотирьох місяців розслідування, в ході якого Руотоло не відмовився від своїх слів, він був відсторонений і змушений пройти психіатричну експертизу. Вони показали, що він був осудним.
13 квітня 1908 року був викликаний до Неаполя настоятелями згромадження, які провели над ним обряд екзорцизму.
Він переїхав до Россано в Калабрії; 8 серпня 1910 року прохання про перегляд його відсторонення мало позитивний результат, і після двох з половиною років відсторонення він був реабілітований. Вдруге його викликали до Риму в грудні 1911 року, а потім знову відправили до Неаполя в 1912 році. Судимий на канонічному процесі в 1921 році, засуджений і знову вилучений. Остаточно реабілітований 17 липня 1937 року, у віці 55 років.
Його життя як єпархіального священика продовжилося в Неаполі, в церкві Сан Джузеппе деі Нуді, парафіяльним священиком якої був його брат Еліо. Тут отець Доліндо був засновником "Діла Божого" та опери "Апостолато Стампа".
Руотоло залишив "Коментар на Святе Письмо" у 33 томах, багато богословських, аскетичних і містичних творів, цілі томи епістолярію, автобіографічних творів і християнського віровчення.
Коментар на Святе Письмо прийняв традиційний екзегетичний метод у спробі реконструювати розрив між наукою і вірою в екзегетиці, метод, проти якого згодом боролися Папський біблійний інститут і Папська біблійна комісія, очолювані відповідно Огюстеном Беа і Еженом Тіссераном.
Його діяльність була засуджена Священною канцелярією.
Серед творів, написаних отцем Доліндо Руотоло, є також "Акт відречення": короткий твір, який, подібно до містичної лінії, запропонованої Жан-П'єром де Коссадом, стосується певної і повної віддачі вірних в руки Христос.
Як зазначається в тексті: "Відмовитися від себе - означає тихо закрити очі душі, відвернути думки від страждань і віддати себе Мені, щоб Я Сам міг працювати, кажучи: "Ви подумайте про це" (...). (...) Закрий очі і дозволь понести себе течією Моєї благодаті, закрий очі і не думай про сьогодення, відверни свої думки від майбутнього, як від спокуси, спочинь у Мені, вірячи в Мою доброту, і Я присягаюся тобі Моєю любов'ю, що, звертаючись до Мене з такими настановами, ти будеш жити в Моїй благодаті: "Ти думаєш про це", Я думаю про це повністю, Я втішаю тебе, Я звільняю тебе, Я направляю тебе".
На цьому ж рівні стоїть ще одна важлива праця отця Доліндо: "Новенна зречення" - молитовний інструмент, простий і водночас потужний: "...Закрий очі і дозволь понести себе течією Моєї благодаті, закрий очі і не думай про сьогодення, відвернувши думки свої від майбутнього, як від спокуси, спочивай у Мені, вірячи в Мою доброту...".
У 1960 році внаслідок інсульту отримав параліч лівої половини тіла. Помер 19 листопада 1970 року.
Його тіло поховане в церкві Сан Джузеппе деі Веккі та Лурдської Богоматері в Неаполі.
Серед неаполітанців прийнято тричі стукати по мармуру його могили в ім'я Пресвятої Трійці, молячись таким чином про отримання духовних і матеріальних благодатей за його заступництвом, тому що сказав: "Прийдіть і постукайте до мого гробу... Я відповім вам".
Культ отця Доліндо
Про нього говорив святий Піо з П'єтрельчіни неаполітанським вірним, які здійснювали до нього паломництво: "Навіщо приїжджати сюди, коли у вас є дон Доліндо в Неаполі? Ідіть до нього, він святий".
З ім'ям Доліндо Руотоло пов'язане також послання, яке віруючі вважають пророчим, від 2 липня 1965 року, зображене на звороті образу Богоматері і адресоване поляку Вітаутасу Ласковському. У документі, завіреному єпископом Павлом Гнилицею, йдеться про кінець комунізму: "Марія для душі. Світ прямує до загибелі, але Польща, як і за часів Собеського, завдяки відданості, яку вона має в моєму серці, буде сьогодні подібна до тих 20 000, які врятували Європу і світ від турецької тиранії. Тепер Польща звільнить світ від найстрашнішої комуністичної тиранії. Встає новий Іван, який героїчним маршем розірве кайдани, вийшовши за межі, накладені комуністичною тиранією. Запам'ятай це. Благословляю Польщу. Благословляю тебе. Благослови мене. Бідолашний дон Доліндо Руотоло - Via Salvator Rosa, 58, Неаполь".
Багато хто вважає його поборником неаполітанської духовності та католицької церкви, він спочиває в церкві Сан-Джузеппе-дей-Веккі, а в церкві Сан-Джузеппе-дей-Нуді знаходиться могила його брата Еліо.
Наразі триває процес канонізації.